隨著現代醫療技術的發展，特別是外科手術技術的日益復雜，國內許多大中型醫院相繼建立了
醫院潔凈工程。其中，醫用手術室很普及，既要無塵又要無菌，采用空氣凈化措施，讓空氣中的塵埃離子過濾，使細菌無載體傳播，從而可以杜絕因環境導致的感染，提高醫療質量。通過醫院潔凈工程技術方面的各種設施和嚴格管理，使室內微粒子含量、氣流、壓力等也控制在一定范圍內，這種房間空間稱潔凈室。
醫院潔凈工程在醫藥業的應用：
1.藥品生產我國的《藥品生產管理規范》（GMP）已在全國范圍內實施，對生產環境提出了相應于工藝過程的不同潔凈級別要求。除了限定空氣中塵埃粒子的大小和含量外，對生物粒子（細菌數）也有明確的限制。
2.醫院白血病的治療室、燒傷病房、外科手術室，根據條件用相應的潔凈技術來防止空氣中的細菌感染，對治療起到環境保障作用。
3.醫學科學實驗對于實驗動物的飼養、遺傳工程等學科實驗工程，也應該具備潔凈環境，才能取得有效的成果。
醫院潔凈工程是一項綜合性技術，作為一個合理的設計，不僅只考慮凈化空調裝置和設施，而且要求建筑設計與工藝密切配合。在設計潔凈室時，對與工程選址、工藝布置、建筑處理、建筑材料等的具體原則，典型的潔凈室人身凈化處理的流程，不同級別的潔凈室和機械設備占用潔凈室面積也不同。建筑平面設計必須滿足這一基本要求。
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